Dans une petite expérience, les eaux usées des avions se sont avérées pratiques et utiles pour surveiller les variantes du SRAS-CoV-2 qui atterrissent aux États-Unis, Les Centers for Disease Control and Prevention ont rapporté jeudi.
L’étude a révélé que le test pouvait être effectué à peu de frais et facilement. Cela n’a ajouté qu’environ trois minutes supplémentaires aux temps de maintenance des avions dans les aéroports et n’a pas obligé les passagers à être dérangés avec des écouvillons nasaux ou d’autres méthodes d’échantillonnage. De plus, les tests peuvent être facilement étendus au besoin, car le monde abandonne largement les autres stratégies de test et de surveillance du SRAS-CoV-2, ont conclu les auteurs du CDC.
Les auteurs concluent : « Cette enquête a démontré la faisabilité de la surveillance des eaux usées des avions en tant qu’approche à faibles ressources par rapport aux tests individuels de surveillance des variantes du SRAS-CoV-2 sans implication directe des passagers ni perturbation des opérations aéroportuaires.
Le CDC a mené l’étude en collaboration avec la société de biotechnologie Ginkgo Bioworks. Ensemble, ils ont collecté et testé des échantillons d’eaux usées de 80 vols à destination de l’aéroport international JFK de New York entre le 1er août et le 9 septembre 2022. Tous les vols étaient internationaux, en provenance du Royaume-Uni, des Pays-Bas et de France.
Dans l’ensemble, 65 échantillons d’eaux usées en suspension dans l’air provenant de 80 vols (81%) ont été testés positifs pour le SRAS-CoV-2. Le taux d’échantillons positifs était le même dans les trois pays : les échantillons des Pays-Bas étaient positifs à 81 %, avec 22 échantillons positifs sur 27 ; Il en était de même pour la France, où 22 échantillons sur 27 se sont révélés positifs ; Tout comme le Royaume-Uni, avec 21 des 26 échantillons positifs.
Les chercheurs ont pu obtenir 27 séquences du génome à partir de 25 échantillons. Tous les génomes ont révélé des sous-lignées omicron, principalement BA.5 ainsi que BA.4.6 et BA.2.75.
L’étude ajoute à d’autres preuves que la surveillance des eaux usées dans les aéroports et les avions peut jouer un rôle dans le contrôle de la propagation d’agents pathogènes, tels que le SRAS-CoV-2. Et cela chevauche les efforts plus larges déployés à l’époque de la pandémie par les Centers for Disease Control and Prevention pour incorporer des échantillons d’eaux usées dans les systèmes de surveillance des agents pathogènes.
Cela s’est avéré utile dans divers endroits du pays pour surveiller les premiers pics de COVID-19 ainsi que pour suivre la propagation de la poliomyélite à New York. Dans le cas du SRAS-CoV-2, l’élimination du virus dans les selles peut commencer très tôt dans l’infection, potentiellement avant qu’une personne ne présente des symptômes.
Il y a bien sûr des restrictions sur le contrôle des aéronefs. Cela sera surtout utile pour les longs trajets, car les gens sont plus susceptibles d’utiliser les toilettes. Il n’est pas clair si toutes les compagnies aériennes accepteront l’échantillonnage. Enfin, étant donné que les voyageurs internationaux peuvent obtenir divers vols de correspondance avant d’arriver aux États-Unis, il peut ne pas être possible de retracer l’origine des variantes arrivant aux États-Unis.
Pourtant, les auteurs disent que la surveillance a sa place. « En combinaison avec la surveillance basée sur les passagers, la surveillance des eaux usées des avions peut fournir un système d’alerte précoce complémentaire pour détecter les variantes du SRAS-CoV-2 et d’autres agents pathogènes préoccupants pour la santé publique. »
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