Des scientifiques de Harvard ont créé un outil d’édition de gènes qui peut concurrencer CRISPR

Des chercheurs du Wyss Institute of Engineering d’inspiration biologique de l’Université Harvard Créé Un nouvel outil d’édition de gènes pourrait permettre aux scientifiques de mener des millions d’expériences génétiques simultanément. Ils l’appellent la technologie Retron Library Recombineering (RLR), et elle utilise des morceaux d’ADN bactérien appelés rétons qui peuvent produire des morceaux d’ADN simple brin.

En ce qui concerne l’édition de gènes, CRISPR-Cas9 est probablement la technologie la plus populaire de nos jours. Il a fait des vagues dans le monde scientifique au cours des dernières années, donnant aux chercheurs l’outil dont ils ont besoin pour être en mesure de modifier facilement les séquences d’ADN. Il est plus précis que les techniques précédemment utilisées et présente une variété de Applications potentielles, Comprenant Traitements salvateurs Pour diverses maladies.

Cependant, l’outil a quelques limitations majeures. Il peut être difficile de livrer des matériaux CRISPR-Cas9 en grand nombre, ce qui reste un problème pour les études et les expériences, par exemple. En outre, le fonctionnement de cette technologie peut être cytotoxique, car l’enzyme Cas9 – le «clipper» moléculaire responsable de la coupure des brins d’ADN – coupe souvent également les sites non cibles.

La technologie CRISPR-Cas9 coupe en fait l’ADN pour incorporer des séquences de mutations dans son génome pendant le processus de réparation. Pendant ce temps, les rétons peuvent insérer le brin d’ADN muté dans la cellule dupliquée, de sorte que le brin peut être incorporé dans l’ADN des cellules filles. De plus, les retrons peuvent servir de «codes-barres» ou de «cartes de visite», permettant aux scientifiques de suivre des individus dans une population de bactéries. Cela signifie qu’il peut être utilisé pour l’édition du génome sans endommager l’ADN d’origine, et il peut être utilisé pour effectuer plusieurs expériences dans un grand mélange.

Les scientifiques de Wyss ont testé le RLR sur Coli Et les bactéries ont découvert que 90% de la population incorporait la séquence du rétron après quelques modifications. Ils ont également pu prouver son utilité dans des expériences génétiques massives. Au cours de leurs tests, ils ont pu trouver des mutations de résistance aux antibiotiques chez Coli En séquençant le code-barres des rétons plutôt qu’en séquençant des mutants individuels, ce qui rend le processus beaucoup plus rapide.

le une étude Le premier co-auteur Max Schubert a expliqué:

«RLR nous a permis de faire quelque chose d’impossible à faire avec CRISPR: nous avons découpé au hasard un génome bactérien, converti ces segments génétiques en ADN simple brin in situ et l’avons utilisé pour cribler des millions de séquences à la fois. RLR est le plus simple et le plus flexible Outil d’édition de gènes utilisable dans les expériences Hautement multiplexé, qui élimine la toxicité souvent observée avec CRISPR et améliore la capacité des chercheurs à explorer les mutations au niveau du génome.

Pendant longtemps, CRISPR a été considéré comme une chose étrange pour les bactéries, et la découverte de la façon dont il exploitait l’ingénierie du génome a changé le monde. Retrons est une autre innovation bactérienne qui peut également fournir des avancées importantes. »

Il y a encore du travail à faire avant que RLR puisse être largement utilisé, notamment en améliorant et en normalisant son taux de libération. L’équipe estime cependant que cela pourrait «conduire à des innovations nouvelles, passionnantes et inattendues».