Plus de 5 000 nouveaux types de virus ont été identifiés dans les océans du monde, selon une nouvelle étude.
Les chercheurs de l’étude ont analysé des dizaines de milliers d’échantillons d’eau du monde entier, à la recherche de virus à ARN ou de virus utilisant ARN comme matériel héréditaire. Le nouveau coronavirus, par exemple, est un type de virus à ARN. Ces virus sont étudiés en comparaison avec les virus à ADN qui utilisent ADN En tant que matériel génétique, ont déclaré les auteurs.
La diversité des virus nouvellement découverts était si grande que les chercheurs ont suggéré de doubler le nombre de groupes taxonomiques nécessaires pour classer les virus à ARN, des 5 à 10 phylums actuels. (Era est une large classification en biologie qui relève du « royaume ».)
« Il y a beaucoup de nouvelles variétés ici – et une diversité complète [new] Un phylum, Taraviricota, se trouve dans tous les océans, ce qui indique qu’il est écologiquement important », a déclaré l’auteur principal de l’étude, Matthew Sullivan, professeur de microbiologie à l’Ohio State University. Il a déclaré dans un communiqué (Ouvre dans un nouvel onglet).
à propos de: Le virus le plus meurtrier de l’histoire
Selon Sullivan, les études sur les virus à ARN se sont généralement concentrées sur ceux qui causent la maladie. (Certains virus à ARN bien connus comprennent la grippe, Ebola et le coronavirus qui cause le COVID-19.) Mais ce n’est qu’une « petite tranche » de virus à ARN sur Terre, a déclaré Sullivan.
« Nous voulions l’étudier systématiquement à très grande échelle et explorer un environnement que personne n’avait examiné en profondeur », a déclaré Sullivan dans le communiqué.
Pour l’étude publiée jeudi 7 avril dans la revue Science (Ouvre dans un nouvel onglet)Dans l’étude, les chercheurs ont analysé 35 000 échantillons d’eau prélevés sur 121 sites dans les cinq océans du monde. Les chercheurs font partie du Tara Ocean Consortium, un projet mondial pour étudier l’impact de Changement climatique sur l’océan.
Les chercheurs ont déclaré avoir examiné des séquences génétiques extraites de petits organismes aquatiques connus sous le nom de plancton, qui sont des hôtes communs pour les virus à ARN. Ils se sont installés sur des séquences appartenant à des virus à ARN en recherchant un gène ancien appelé RdRp, qui se trouve dans tous les virus à ARN mais est absent des autres virus et cellules. Ils ont identifié plus de 44 000 séquences avec ce gène.
Mais le gène RdRp a des milliards d’années et il a évolué de nombreuses fois. Parce que l’évolution du gène remonte à loin, il a été difficile pour les chercheurs de déterminer la relation évolutive entre les séquences. Les chercheurs ont donc utilisé l’apprentissage automatique pour les organiser.
Dans l’ensemble, ils ont identifié environ 5 500 nouvelles espèces de virus à ARN appartenant aux cinq classes existantes, ainsi que les cinq classes nouvellement proposées, que les chercheurs ont nommées Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota et Arctiviricota.
Les espèces de virus du phylum Taraviricota étaient particulièrement abondantes dans les eaux tempérées et tropicales, tandis que les virus du phylum Arctiviricota sont abondants dans l’océan Arctique, écrivent les chercheurs dans Conversation. (Ouvre dans un nouvel onglet)
Comprendre comment le gène RdRp varie dans le temps peut conduire à une meilleure compréhension du développement de la petite enfance TerreLes auteurs ont dit.
« RdRp est présumé être l’un des gènes les plus anciens – il était présent avant que l’ADN ne soit nécessaire », a déclaré le co-premier auteur de l’étude, Ahmed Zayed, chercheur en microbiologie dans l’État de l’Ohio, dans le communiqué. Nous traçons donc non seulement l’origine des virus, mais aussi les origines de la vie.
Publié à l’origine sur Live Science.
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